早期肾小球肾炎影响肾小球滤过功能障碍、肾小管重吸收和分泌功能障碍，导致肾缺血、肾素-血管紧张素-醛固酮系统激活和高血压。肾小球肾炎持续进展，导致肾功能受损、肾小球滤过率降低和电解质失衡。
大量蛋白质或红细胞异常渗漏到尿液中大量蛋白质渗漏导致血浆低白蛋白血症低白蛋白血症会降低身体的抵抗力，使血液粘稠，并导致血栓性疾病容易发生下肢水肿。持续的肉眼血尿会导致患者贫血，还可能诱发尿路感染，因为血液是极好的细菌培养基。例如，高钾血症可导致心脏骤停、恶性心律失常，严重时可导致死亡；高磷血症可引起皮肤瘙痒；还可能伴有血小板减少、贫血等全身衰竭。